К 1940 году аптечное дело в стране имело четкую организационную структуру и располагало развитой сетью аптечных учреждений, позволявших эффективно осуществлять лекарственное снабжение населения и контроль качества фармацевтической продукции: функционировало 9273 аптеки, 1400 аптекарских магазинов, 13864 аптечных пунктов, 270 аптечных складов, 149 галеново-фармацевтических фабрик и лабораторий.

К началу 1941 года аптечная система имела 295 контрольно-аналитических лабораторий при аптечных управлениях и 1133 контрольно-аналитических кабинетов и столов в аптеках. С началом Великой Отечественной войны аптечная система страны, как и все народное хозяйство, понесла большие потери. Военные действия на территории Советского Союза привели к тому, что количество аптек к 1943 году сократилось до 6221, магазинов – до 281, киосков и аптечных пунктов до 5762. Число фармацевтов, работавших в аптечных учреждениях, за 1941 - 1942 года сократилось более чем наполовину.

В условиях военного времени многие аптечные работники были мобилизованы в ряды Красной Армии. В связи с этим были установлены новые штатные расписания, произведено перераспределение аптечных работников и ни одна аптека не прекратила своей работы по лекарственному снабжению населения. С первых же дней войны они переключились на выполнение специальных заданий для нужд фронта.

Работа там шла круглосуточно, готовились инъекционные растворы, консервированная кровь, перевязочные материалы, шины и другие необходимые средства.

Кроме того, на плечах фармацевтов лежала и хозяйственная часть жизни военного госпиталя: они вели документацию, получали медикаменты, стерилизовали растворы, мыли аптечную посуду.

К началу войны в СССР действовало 59 химико-фармацевтических предприятий, был освоен выпуск целого ряда новых для того времени препаратов, которые в военное время спасали жизни раненых, но, в то же время, с оккупированных территорий удалось вывезти далеко не все производства.

Летом 1941 были потеряны многие фармацевтические производства в приграничных зонах. Оставшиеся заводы до начала 1942 вырабатывали 1/10 необходимых средств. Катастрофически не хватало морфина, эфира для наркоза, йода, так необходимого в полевой хирургии, и даже аспирина.

Аптечные управления восточных регионов страны, куда была эвакуирована значительная часть промышленности, расширяли аптечную сеть. На Урале, в Западной Сибири и в Приуралье дополнительно было открыто 54 городских и 25 сельских аптек.

В апреле 1943 года открылась областная контрольно-аналитическая лаборатория в Кемерово, с которой началась история контроля качества лекарственных средств в Кузбассе.

Областная контрольно-аналитическая лаборатория являлась структурным подразделением Главного аптечного управления Министерства здравоохранения Кемеровского областного отделения и выполняла основную функцию - анализ лекарственных средств, ввезенных в область и изготовленных аптечными организациями области. В этот период в Кузбассе было 6 производственных аптек (№ 1, 2, 3, 4, 5, 6).

С 1943 г. по 1994 г. качество лекарственных средств, поступающих в Кемеровскую область и изготовленных на ее территории, проверялось областной контрольно-аналитической лабораторией.

В результате ряда реорганизаций и преобразований на базе испытательной лаборатории в ноябре 2011 г. было создано Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Центр контроля качества и сертификации лекарственных средств» (ГБУЗ ЦККСЛС).